Viện Nghiên cứu Y dược học Thăng Long hoạt động dựa trên những tầm nhìn, định hướng của Hội đồng quản lý và được hỗ trợ, tham mưu bởi Ban cố vấn bao gồm những giáo sư, tiến sỹ, chuyên gia trong lâm sàng cũng như trong nghiên cứu y khoa.
Hội đồng Đạo đức và Hội đồng Khoa học của Viện là các Giáo sư, Phó Giáo sư, Tiến sỹ và chuyên gia về lĩnh vực Dịch tễ, Vi sinh, Nhi khoa, Hóa sinh,…, được thành lập nhằm mục đích xem xét, đánh giá, phê duyệt khía cạnh đạo đức và tính khoa học của các đề tài nghiên cứu.
Nhân sự được tuyển chọn vào Viện là những Giáo sư, Phó Giáo sư, Tiến sỹ, Thạc sỹ, Bác sỹ, Cử nhân có tâm huyết với công việc.
Viện có một đội ngũ cán bộ trẻ trung và năng động, có chuyên môn vững vàng và đã có kinh nghiệm nhất định trong lĩnh vực y dược học.
Viện coi trọng việc hợp tác với các chuyên gia trong và ngoài nước có kinh nghiệm và trình độ chuyên môn, quản lý để ký kết thực hiện các nội dung hoạt động của Viện với hình thức hợp đồng theo từng đề tài, đề án.
Labo Giải phẫu bệnh và Sinh học phân tử là trung tâm xét nghiệm trực thuộc Viện Nghiên cứu Y dược học Thăng Long thực hiện nhiệm vụ tiếp nhận, thực hiện các xét nghiệm chẩn đoán tế bào học, mô bệnh học, hóa mô miễn dịch, sinh học phân tử và lưu trữ các sản phẩm sinh học; Hợp tác với các tổ chức trong và ngoài nước liên quan đến nghiên cứu, ứng dụng khoa học công nghệ mới trong chẩn đoán và điều trị.
Tạp chí khoa học: Y dược ngày nay là tạp chí khoa học ngành y dược được thành lập và quản lý bởi Viện Nghiên cứu Y dược học Thăng Long. Tạp chí đăng tải những nghiên cứu, thông tin về y tế, sức khoẻ trong nước và quốc tế.